Il existe plusieurs manières d'appeler procmail, selon que l'administrateur système est coopératif ou non ! Il est en effet possible d'utiliser procmail de manière globale (procmail peut servir de filtre général, avant même la livraison du courrier à chaque utilisateur - pour passer un anti-virus à l'entrée du système, par exemple), ou bien de manière individuelle (utilisation de procmail sans disposer de droits particuliers autres que ceux du répertoire personnel).